《太子妃升職記》在網上傳開了三個不同的結局，其中之一讓人震驚不已。原來張鵬在現實中醒來時，才意識到齊晟是自己的意識被植入進去的，他是一位腦科醫生通過腦復蘇刺激的方式實現了這一切。

結局一：情節發展至齊晟和張芃芃被刺殺后，張芃芃的靈魂回到了現代，同時張鵬的身體也康復了。而當他醒來時，才發現自己內心的靈魂是齊晟的。此刻，張鵬回憶起與張芃芃在過去點點滴滴的時光。在畫面跳轉的瞬間，張鵬和齊晟同時出現在一起，這個鏡頭暗示了齊晟的靈魂也穿越到了張鵬的身體里。至于女主張芃芃（張鵬），她并未現身，為故事留下了懸念。

結局二：齊晟和張芃芃并未被刺殺，但當張芃芃看到地上的心形鮮花時，她幸福感爆棚，意識突然回到了現代（或許導演企圖在此創造出一種莊周夢蝶的意境，畢竟美夢總會醒來）。醒來后，張鵬在病房門口遇見了一個和齊晟一模一樣的男醫生。

結局三：故事情節和前面相同，兩個人死了，但在幻境中張芃芃竟然復活了。她開始尋找男主角，最終發現了身穿戰袍的男主。他們準備接吻時，導演卻叫兩位配角（實際上就是男女主角）退到一旁，不要妨礙他們拍戲！于是，畫面轉變，男女主角換上現代服裝，在街頭擺出接吻的姿勢。而之前扮演小妾太監的演員則穿著現代服裝站在一旁觀看。