菖蒲這類植物喜歡陰涼濕潤的環境，因此相較于土栽，水培更為適合。在室內觀賞中，水培是主要的種植方式，只要保證清水不干涸，菖蒲的壽命可以達到數十年。

水培方法主要適用于具有大塊老根的菖蒲植株。老根高出泥面并且彎曲如龍的植株效果更好。可以將零散的小株菖蒲聚集在一起，用棕櫚皮包裹后放入水盆中。而小株菖蒲的根系比較短，可以用漆包線串聯這些植株成團，但要注意不要傷及老根，同時在漆包線上繞幾圈來固定。

在種植時，可以根據個人喜好和植株的大小選擇中等深度的不漏水的花器。將菖蒲莖段清洗干凈，修剪掉老根和過長根。隨后，放入高錳酸鉀溶液中浸泡2小時以進行殺菌消毒。將卵石放入花器中，將植株固定在花器內，水平面略過根部即可。另外需要注意的是，不要將葉片浸泡在水中，并將植株放置于充足的光線下，避免陽光直射。

在水培菖蒲的后期養護中，除了及時補充水分外，還需定期添加少量花肥來供給養分，以促進植株的生長。菖蒲具有耐寒性，在冬季只需清理枯枝和殘葉即可。而在夏季炎熱的氣候下，需要將菖蒲水盆放置在陰涼處，以避免水分的蒸發和養分的過度消耗。